Российская нефтяная компания ЮКОС была основана в 1993 году указом президента «в целях повышения эффективности работы нефтяного комплекса Российской Федерации, обеспечения надежного снабжения потребителей нефтью и нефтепродуктами». В декабре 1995 года в результате залоговых аукционов компания перешла из-под контроля государства под контроль группы «Менатеп» Михаила Ходорковского. После чего в период с 1995 по 2005 годы неизменно входила в Топ-10 крупнейших компаний России по версии журнала «Эксперт».

Между тем, в 2003 году против НК «ЮКОС» Министерство Российской Федерации по налогам и сборам (после проведения административной реформы - Федеральная налоговая служба России) возбудило расследование по поводу уклонения НК «ЮКОС» от уплаты налогов в 2000-2003 годах на общую сумму 582 млрд руб. (с учетом претензий к дочерним обществам - 703 млрд руб.).

В 2006 году арбитражным судом Москвы было принято решение о банкротстве компании. Совладелец и глава НК ЮКОС в период 1997-2004 гг. Михаил Ходорковский с 2003 года отбывает 13-летнее заключение в Карелии. Его коллега по бизнесу, российский бизнесмен, соучредитель банка «МЕНАТЕП», бывший председатель совета директоров группы «МЕНАТЕП» Платон Лебедев отбывает с того же года 14-летнее заключение в Архангельской области.